PS CS4 Extended: Die Erweiterungen zur medizinischen Analyse verwenden

PS CS4 Extended: Die Erweiterungen zur medizinischen Analyse verwenden

In diesem Video und dem begleitenden Text-Tutorial zeigen ich Ihnen, wie Sie mit Adobe Photoshop CS4 Extended Messungen und Zählungen durchführen können. Als Beispielmaterial verwende ich dabei medizinische Aufnahmen von Zellen. Aber selbst wenn Sie kein Mediziner sind schauen Sie sich dieses Video doch an – Ihnen fallen bestimmt zahlreiche Situationen ein, in denen Sie die Mess- und Zählfunktionen von Photoshop Extended einsetzen.

Rohdaten:
Die Dateien zum Nachmachen dieses Tutorials können Sie hier herunterladen!

Adobe® Photoshop® CS4 Extended bietet diverse Erweiterungen zur Durchführung medizinischer Analysen. In diesem Tutorial lernen Sie, wie Sie die Funktionen zum Skalieren, Vermessen und Zählen verwenden.

Ein DICOM-Bild öffnen

Photoshop CS4 Extended enthält eine Reihe fortschrittlicher medizinischer Analysewerkzeuge zur Bearbeitung von Bildern im DICOM-Format (Digital Imaging and Communications in Medicine).
So öffnen Sie ein DICOM-Bild:
1. Wählen Sie Datei > Öffnen und markieren Sie ein DICOM-Bild (Dateiendung .dcm). Klicken Sie auf Öffnen. Das Dialogfenster zum Öffnen von DICOM-Dateien erscheint.
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Abbildung 1: Ein DICOM-Bild auswählen
2. Wählen Sie alle Einzelbilder der DICOM-Datei aus, indem Sie die Schaltfläche Alle auswählen oben links im Dialogfenster anklicken.
3. Markieren Sie in der rechten oberen Ecke des Dialogfensters das Auswahlfeld Als Volume importieren.
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Abbildung 2: Mehrere Bilder importieren
4. Klicken Sie auf Öffnen, um die Importeinstellungen anzuwenden und den Importvorgang abzuschließen.
Anmerkung: Photoshop öffnet das Bild als fertig gerendertes 3D-Objekt.

Die Werkzeuge 3D-Objekt drehen und Skalenmarkierung verwenden

Mit Photoshop CS4 Extended können Sie DICOM-Bilder drehen und skalieren, um sie noch genauer zu untersuchen.
So drehen Sie ein Bild:
1. Wählen Sie das 3D-Objekt-drehen-Werkzeug aus dem Werkzeugbedienfeld von Photoshop.
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Abbildung 3: Das 3D-Objekt-drehen-Werkzeug
2. Ziehen Sie das Bild, um es auf dem Bildschirm zu drehen. Beachten Sie, dass es drei Rotationsachsen gibt: x, y und z.
3. Falls das DICOM-Bild Skaleninformationen enthält, wendet Photoshop CS4 Extended diese Größenskala automatisch auf das Bild an. Über Analyse > Messskala festlegen > Benutzerdefiniert können Sie diese Information abrufen. Das Dialogfenster Messskala öffnet sich.
4. Zum Verändern der Standardskala geben Sie die gewünschte Maßeinheit in das Feld Logische Einheit ein, zum Beispiel Mikrometer. Standardmäßig verwendet Photoshop ein festes 1:1-Verhältnis von Pixeln zur logischen Einheit (ein Pixel würde nun also einem Mikrometer Länge entsprechen). Sie können in den Feldern Pixellänge und Logische Länge jedoch auch abweichende Werte definieren. Wenn sich außerdem in Ihrem Bild ein Objekt befindet, das Sie als Standard für alle weiteren Messungen verwenden möchten, klicken Sie in das Feld Pixellänge und ziehen Sie die Maus über das Objekt. Photoshop aktiviert das Linealwerkzeug, das die genaue Länge des Objekts in Pixel ermittelt. Nachdem Sie Ihre eigene Messskala fertiggestellt haben, wenden Sie die Änderungen mit OK an.
5. Über Analyse > Skalenmarkierung platzieren setzen Sie eine Skalenmarkierung in die untere linke Ecke des Dokumentfensters. Das Dialogfenster Skalenmarkierung öffnet sich.
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Abbildung 4: Das Dialogfenster Skalenmarkierung
6. Sie können auch eine andere Schrift für die Skalenmarkierung wählen. Standardmäßig ist Helvetica voreingestellt. Den Text, auf den die Schrift angewendet wird, können Sie verändern, nachdem Sie ihn in bearbeitbaren Live-Text umgewandelt haben (siehe Schritt 9).
7. Mit den Standardwerten für Textposition und Farbe (wie in Abbildung 5 dargestellt) erscheint die Markierung in der unteren linken Bildecke in Schwarz. Mit OK fügen Sie die Markierung ein.
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Abbildung 5: Festlegen von Textposition und Farbe
8. Die Position der Markierung können Sie mit dem Verschieben-Werkzeug aus dem Werkzeugbedienfeld beeinflussen. Ziehen Sie die Markierung etwas von dem DICOM-Bild weg.
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Abbildung 6: Die Skalenmarkierung verschieben
9. Wählen Sie die Textebene im Ebenenbedienfeld aus. Drücken Sie die Pfeiltaste nach unten, um den Text von der Markierung zu entfernen. So verbessern Sie die Lesbarkeit. An dieser Stelle können Sie den Text bei Bedarf auch bearbeiten.
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Abbildung 7: Die Textebene markieren

Objekte vermessen

Innerhalb eines DICOM-Bilds können Sie Objekte mit den neuen Messwerkzeugen vermessen.
So verwenden Sie die Vermessungsfunktionen:
1. Schließen Sie als Vorbereitung für den nächsten Abschnitt die Textebenengruppe und wählen Sie die Hintergrundebene aus.
2. Wählen Sie das Linealwerkzeug. Es befindet sich im Werkzeugbedienfeld im Popup-Menü des Pipette-Werkzeugs.
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Abbildung 8: Das Linealwerkzeug verwenden
3. Ziehen Sie die Maus innerhalb des DICOM-Bilds über die gesamte Breite des zu messenden Objekts. Möglicherweise empfiehlt es sich, zwecks höherer Genauigkeit vor der Messung näher heranzuzoomen.
4. Wählen Sie Fenster > Messprotokoll. Das Bedienfeld Messprotokoll erscheint am unteren Rand des Photoshop-CS4-Fensters.
5. Klicken Sie im Bedienfeld Messprotokoll auf die Schaltfläche Messungen aufzeichnen. Diverse Metadaten sowie Länge und Winkel der letzten Messung werden in das Messprotokoll aufgenommen.
6. Zur Messung eines Winkels ziehen Sie mit gedrückter Alt-Taste ausgehend von einem der Endpunkte Ihrer letzten Maßlinie eine neue Linie mit dem Linealwerkzeug. Klicken Sie erneut auf Messungen aufzeichnen. Im Bedienfeld Messprotokoll erscheinen drei neue Messungen. Sie geben die Gesamtlänge und den Winkel untereinander für beide Linien an und dann nochmals Längen und Winkel der einzelnen Linien.
7. Sie können auch markierte Flächen innerhalb eines Bilds vermessen. Zur Auswahl einer Fläche verwenden Sie das Zauberstab-Werkzeug. Achten Sie darauf, dass die Toleranz bei 50 liegt und dass das Kontrollfeld Glätten nicht ausgewählt ist. Mit diesen Einstellungen vermeiden Sie unnötige Kantenartefakte.
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Abbildung 9: Eine Fläche auswählen
8. Markieren Sie das zu vermessende Objekt mit einem Mausklick.
Tipp: Bereiche, die das Zauberstab-Werkzeug eventuell übersehen hat, fügen Sie Ihrer Auswahl mit dem Auswahlrechteck-Werkzeug hinzu. Ziehen Sie dazu jeweils mit gedrückter Umschalt-Taste ein Auswahlrechteck auf.
9. Klicken Sie mit dem Zauberstab-Werkzeug und gedrückter Umschalt-Taste in ein anderes Bildobjekt. Nun sind zwei Bildobjekte für die Messung markiert.
10. Klicken Sie im Bedienfeld Messprotokoll auf Messungen aufzeichnen. Drei neue Messungen werden dem Protokoll hinzugefügt. Die erste Messung entspricht den Gesamtabmessungen der beiden markierten Objekte. Die beiden anderen Messungen gelten jeweils für einzelne markierte Objekte. Für ausgewählte Bildbereiche zeichnet Photoshop typischerweise Werte wie Fläche, Umfang und Kreisförmigkeit auf.
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Abbildung 10: Das Bedienfeld Messprotokoll
Anmerkung: Wenn Sie sich die Metadaten der Messungen ansehen, erkennen Sie, dass die Quelle der einzelnen Messungen jeweils eine Auswahl ist

Das Zählungswerkzeug

Das Zählungswerkzeug wurde für Photoshop CS4 Extended verbessert.
So setzen Sie das Zählungswerkzeug ein:
1. Heben Sie die Auswahl der Objekte im DICOM-Bild auf, indem Sie Ctrl/Strg-D drücken.
2. Klappen Sie das Bedienfeld Messprotokoll ein, indem Sie den leeren Bereich rechts von den Registern anklicken.
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Abbildung 11: Bedienfeld Messprotokoll einklappen
Wählen Sie das Zählungswerkzeug aus dem in Abbildung 8 dargestellten Popup-Menü des Linealwerkzeugs. Klicken Sie jeweils einmal in die zu zählenden Objekte.
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Abbildung 12: Das Zählungswerkzeug verwenden
3. Um die Zählpunkte mehr zu betonen, können Sie ihnen eine Farbe zuweisen, die sich vom Bildhintergrund unterscheidet. Klicken Sie zum Verändern der Punktfarbe auf das Farbfeld in der Optionsleiste. Das Dialogfenster Zählungsfarbe auswählen erscheint.
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Abbildung 13: Das Farbfeld für die Zählungsfarbe
4. Wählen Sie eine Farbe, die sich deutlich vom Hintergrund des DICOM-Bilds unterscheidet, und klicken Sie auf OK.
5. Zum Vergrößern der Zählmarkierungen und deren Beschriftung erhöhen Sie die Werte für die Markierungs- und Beschriftungsgröße in den entsprechenden Feldern der Optionsleiste (siehe Abbildung 13).
6. Um der Zählungsgruppe einen neuen Namen zuzuweisen, klicken Sie das Menü Zählungsgruppen in der Optionsleiste an und wählen Sie Umbenennen. Ein Dialogfenster fordert Sie zur Eingabe eines neuen Zählgruppennamens auf. Geben Sie hier den neuen Namen ein und klicken Sie auf OK.
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Abbildung 14: Die Zählungsgruppe umbenennen
7. Eine neue Zählungsgruppe erzeugen Sie über die Schaltfläche Neue Zählungsgruppe in der Optionsleiste. Geben Sie in das Dialogfenster Zählungsgruppenname den Namen der neuen Gruppe ein.
Anmerkung: Es empfiehlt sich möglicherweise, den Zählmarkierungen der neuen Zählungsgruppe eine andere Farbe zuzuweisen. Wiederholen Sie dazu die Schritte 3 und 4. Gemäß Schritt 5 können Sie auch andere Markierungs- und Beschriftungsgrößen einsetzen.
8. Um die gezählten Elemente in das Bedienfeld Messprotokoll zu übernehmen, klappen Sie dieses zunächst auf. Klicken Sie dazu auf den leeren Bereich rechts vom Register (siehe Abbildung 11).
9. Klicken Sie auf Messungen aufzeichnen oder verwenden Sie die Tastenkombination Ctrl/Strg-Umschalt-M. Photoshop protokolliert die Anzahl und gibt sie im Bedienfeld Messprotokoll wieder.
10. Wählen Sie Datei > Sichern, um die Datei abzuspeichern. Photoshop CS4 sichert die Zählung und alle weiteren Messdaten gemeinsam mit dem Bild, so dass sie auch von anderen Anwendern gelesen werden können.
11. Mit dem Symbol Alle Messungen auswählen in der oberen rechten Ecke des Bedienfelds Messprotokoll können Sie alle Messungen gleichzeitig markieren.
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Abbildung 15: Das Symbol Alle Messungen auswählen
12. Zum Exportieren der Messungen als tabulatorseparierte Textdatei klicken Sie auf die Schaltfläche Ausgewählte Messungen exportieren, das zweite Symbol von rechts im Bedienfeld Messprotokoll.

Hinweis: Dieses Tutorial wurde auf Adobe.de veröffentlicht und unterliegt einer Creative Commons Lizenz.

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